Un professeur d'école fait des cauchemars à propos de MacGyver, et lorsqu'une partie de ces rêves se réalise, Peter et MacGyver décident d'enquêter. Ils découvrent que d'anciens agents de la CIA ont monté un marché noir de pièces de missiles volées...
Une ancienne amie de Peter, Soeur Margaret Parnell, et un ancien amour de MacGyver, Debra Easton, sont sur la liste noire d'un régime oppressif d'Asie du Sud. Peter et MacGyver décident de s'y rendre et traversent secrètement les frontières thaïlandaises afin de sauver les deux femmes et les jeunes orphelins dont elles s'occupent...
MacGyver accepte d'aider son ami, Jack Dalton, en l'accompagnant pour une mission de sauvetage en Amérique Centrale. Arrivé sur place, il a la surprise de découvrir qu'il doit libérer Michelle Foster, une ancienne amie, prisonnière d'officiers de police corrompus...
Peter demande à MacGyver d'accompagner des adolescents lors d'une randonnée dans un coin sauvage et désertique. Il est chargé de surveiller quatre chefs de bande qui essayent de se démarquer du groupe. Mais lors du retour, leur avion s'écrase...
Paul Chan, quatorze ans, est le fils d'un ami de MacGyver. Pour le sauver du destin inquiétant que lui réserve une légende vieille de quelques centaines d'années, MacGyver doit faire face à de dangereux Chinois et à de puissantes superstitions...
MacGyver, Peter et Joanne Remmings, une experte de la fondation Phénix, préparent une opération d'envergure. Ils vont en effet tenter de soutirer de l'argent à un arnaqueur, qui a lui-même abusé de la confiance d'un de leur collègue et ami, en lui dérobant toutes ses économies...