Pedrosa, qui est troisième au classement mondial à seulement 19 points des deux leaders, a déjà remporté cinq victoires sur ce petit circuit où les pilotes tournent dans le sens opposé des aiguilles d'une montre. Aux 4e et 5e positions, les pilotes de l'écurie française Tech3, l'Italien Andrea Dovizioso et le Britannique Cal Crutchlow dans cet ordre ont affiché leurs ambitions au guidon de leurs Yamaha M1. L'Espagnol Hector Barbera a placé la première Ducati au 6e rang, devant celle, officielle, de l'Américain Nicky Hayden, qui a terminé quatre fois sur le podium dans le passé. Deux Honda, celle de l'Espagnol Alvaro Bautista qui partira quoi qu'il arrive en fond de grille dimanche après avoir été sanctionné pour conduite dangereuse à Assen, et la RC213 V de l'Allemand Stefan Bradl se placent ensuite aux 8e et 9e rang devant la Yamaha de l'Américain Ben Spies, dernier pilote a avoir été chronométré dans la même seconde que Pedrosa.
 

Sec et pluie

Tous ces chronos ont été réalisés sur le sec, la deuxième séance de l'après-midi ayant démarré après une grosse averse. Sur une piste mouillée, Bradl, chez lui, avait signé le 2e temps et l'Italien Valentino Rossi (Ducati), toujours très à l'aise dans ces conditions, le 5e. En temps cumulé, le nonuple champion du monde, lui aussi vainqueur à cinq reprises au Sachsenring, n'est que 11e, juste devant la première CRT, celle du Français Randy de Puniet (Aprilia), à seulement une seconde et 8/10e de Pedrosa.